I fertilizzanti destinati alla Fertilsud vengono sbarcati nei porti di Bari, Molfetta, Barletta e Manfredonia.

La Fertilsud è in grado di sbarcare 3-4 navi contemporaneamente, raggiungendo, come rata di Sbarco giornaliera, punte di 4000/5000 tonnellate.


Per il trasporto via terra, vengono utilizzati camion idonei, appartenenti ad una cooperativa con cui la Fertilsud ha un rapporto di esclusivo di durata trentennale.
Un rapporto privilegiato è anche quello che lega la Fertilsud a diversi armatori, specializzati nel trasporto di fertilizzanti via mare.